黑帮洪兴社与敌对帮派谈判破裂，双方大打出手。洪兴老大李坤混乱中被刺重伤身亡，社团顿时一团混乱。留学并定居美国的李万豪（周润发 饰）携妻儿回港为父奔丧，在众老叔苦苦哀求下无奈出任龙头一职。虽生在黑社会家庭，但李万豪自幼不参与社团事务，更对江湖上的规矩与利害一无所知，因此一系列改革举措招来了其他帮派的攻击与不满。 　　决意返美的李万豪推举老成持重的谢胜（陈惠敏 饰）担当老大，此举却引来少壮派头目杨港（张耀扬 饰）的不满。内忧外患，处在过渡期的洪兴社风雨飘摇。

一个本性纯良的青年加入了黑社会，不断被他身边的朋友、女友、大佬出卖，并赶尽杀绝，连他身怀六甲的日籍太太也不放过，于是他发誓要做一个最坏最坏的人，最后变成丧尽天良的叻君。但世事真的这样一面倒的只有他是受害者吗？还是另外一回事……-生命垂危的黑帮人叻君（吴镇宇饰）讲述了他被出卖被背叛的一生：曾经天真的他被骗入黑社会，投身于无良黑帮大佬的门下，被朋友出卖，惹来了不少麻烦。叻君终于弃暗投明，来到大佬天生的帮派中间，却还是被朋友、情人相继背叛。叻君与大佬反目，逃亡日本娶妻生子，不料杀手团把已有身孕的妻子残忍杀掉。于

反黑组警长警长肥沙，不慎丢失手枪。这件事非同小可，如果手枪被匪徒用去行凶，肥沙将大祸临头。PTU警官何文展出于义气，答应一定会在天亮之前寻回手枪，带几名手下开展了寻枪行动。另一方面，却在横生枝节：警员Kat死守纪律，坚持要将此事汇报上级处理；而在同一晚，CID的Madam张在接手一单黑社会谋杀案时，怀疑肥沙与黑社会有染，由此与PTU发生意见分歧。人与人，部门与部门之间的矛盾、争斗和角力，在夜幕中徐徐拉开。而第二天清早，揭晓的真相，原来都在他们的意料之外…

一个年轻特警女子，一个国际神偷，还有一个金老板是黑社会的头目，他们这样身份悬殊的三个人，产生了不一样的关系，同时女特警对神偷产生了好感，一切的缘由是一场不打不相识的机遇。

　香港庙街，各路势力云集，犬牙交错。身体残疾、在黑帮老大烟铲乐手下讨生活的盲辉与大陆偷渡过来的女孩小惠相恋。PTU部队利用盲辉端掉黑社会团体和联胜的贩毒窝点，引发和联胜老大丧昆与烟铲乐的冲突。丧昆追杀盲辉之时，遭到乐之手下火爆的伏击，坠楼而死。鉴于恶性案件时有发生，警局展开大规模扑杀行动，庙街中由黑社会把持的店铺被迫关闭。烟铲乐恼羞成怒，迁怒盲辉，致使其与女友流落街头。李永森执勤途中逮捕了滋事的小惠，令盲辉对这个导致自己幸福破碎的沙展萌生恨意……

阿杰与弟弟阿辉相依为命，兄弟感情深厚。因被人诬陷杀害警员被警方追捕而逃回大陆，后获释黑社会头子阿伦逼其弟干非法勾当。为还自己清白，阿杰决意潜回香港洗脱杀害警察的罪名，并挽救弟弟免入歧途。阿伦杀掉黑社会老大并将其嫁祸于阿杰，阿杰和警方合作，缉拿了阿伦，同时也洗脱自己的罪名，证明了自己的清白。

香港特警队督察蓝朗在侦察一宗重大罪案期间，冒死前去营救被黑社会绑架的女友，却反遭陷害，被迫停职退出警界。朗只好在海边开设小餐厅，希望过平静的生活。可是黑社会势力并没有放过他。十年後，从澳洲回港的年轻人阿孝来到海鲜酒家工作，其父当年被蓝朗误杀，而阿孝正要来查明真凶。

《特警三人组》讲述了三个笨蛋警察追查黑社会从而引发的一系列搞笑事件。