改编自1997年的同名电影，这部动画主要讲述了关于一个由致力于为地球上的外星人提供星际移民服务的男人所组成的秘密政府组织的故事。

皇宫突发怪病，症状诡异被称作——狐仙索命。染病的两宫众人被皇后下旨隔离在东宫（冷宫）。 宫中请来郎中叶志理来查明病因，并派遣付高护其左右。叶志理从第一个发病者高厨子查起，却正好目睹其惨死。叶志理顺藤摸瓜找到高厨子的相好婢女月儿。而月儿却被一黑衣人暗杀。在追逐黑衣人的过程中，叶志理发现了容妃和沁妃的秘密。此时地窖突起大火，线索被毁。守门老太独揽罪责。叶志理欲带着沁妃一行人出宫复命。容妃误会叶志理便带着黑衣人进行阻拦，实则是为儿报仇，杀死沁妃。面对容妃的步步紧逼，沁妃道出了不为人知的缘由。正当沁妃要赶尽杀绝之

皇宫突发怪病，症状诡异被称作——狐仙索命。染病的两宫众人被皇后下旨隔离在东宫（冷宫）。 宫中请来郎中叶志理来查明病因，并派遣付高护其左右。叶志理从第一个发病者高厨子查起，却正好目睹其惨死。叶志理顺藤摸瓜找到高厨子的相好婢女月儿。而月儿却被一黑衣人暗杀。在追逐黑衣人的过程中，叶志理发现了容妃和沁妃的秘密。此时地窖突起大火，线索被毁。守门老太独揽罪责。叶志理欲带着沁妃一行人出宫复命。容妃误会叶志理便带着黑衣人进行阻拦，实则是为儿报仇，杀死沁妃。面对容妃的步步紧逼，沁妃道出了不为人知的缘由。正当沁妃要赶尽杀绝之

厌倦了漫长的日子，杰伊使用了快速的克隆，在几小时后融化的临时替身，在他睡觉的时候做他的工作。当邪恶的阿尔法得到一个被融合的杰伊克隆时，他使用DNA来创造一个他自己的快速克隆：杰伊的邪恶孪生兄弟。微小的外星恐怖分子，被称为FMECKS，他们偷走了高科技的人类太空服，让阿奎利亚人在地球上伪装自己。杰伊缩小了规模，抓住了小偷，并揭露了一个摧毁阿奎尔的家园的阴谋。

对一个非法的外星人跳投者的追逐，将凯和杰伊带到杰比的商店，在那里，虫子们恰好在交易中。当凯和杰伊试图逮捕这名罪犯时，一场战斗接踵而至，其间蠕虫们意外地被一种神秘物质粘住。外星人的罪犯利用他的隔离时间来打开时间通道逃跑。Jay过分热心地追求着，发现自己也无意中被卷入了这个门户，在一个令人不安的未来里，蠕虫们统治着地球（想想人猿星球）。与此同时，在现在，被黏着的蠕虫病毒开始分裂并成倍增长，就像变形虫一样。它们是未来蠕虫世界的未知起源。在未来，杰伊被抓获并被判处死刑。只有在四个富有同情心的未来蠕虫人的帮助下，他

阿明（李灿森 饰）、黑仔阿满（梁焯满 饰）、公子龙（张豪龙 饰）是居住在香港的三个小青年，他们穷困潦倒，一事无成，因举借高利贷无力偿还而被人当街追杀。走投无路之际，他们遇见一个神秘的黑衣人，黑衣人要他们祭拜黑龙偶像，即可实现发财的梦想。阿满“为了钱死都可以”，阿龙“只要能发财谁死都行，除了他自己”，阿明“只要能和女友阿雪结婚，做什么都行”。穷极生疯，三人完全不顾后果拜起了黑龙。盲打误撞，他们竟真的开始转运，横财源源不断。然而塞翁失马，焉知非福。正当他们欣喜非常之时，厄运不起而至，当初在黑龙面前许下的承诺一

维多利亚时代的英国小镇莱姆，年轻的绅士查尔斯在海边的悬崖上邂逅了一个神秘黑衣女子。听当地人说，黑衣女子名叫萨拉，因为曾与一名法国中尉有染，所以遭众人非议，被称为“法国中尉的女人”。不过，查尔斯却对这位遗世独立的女人颇感兴趣，尽管他已经有了一个贤淑的未婚妻，并拟定了婚期，但他还是抑制不住萨拉的诱惑。两个人在几次试探后，终于开始幽会…

地球并不只是人类的天下，其实有1500名外星人生活中我们当中，而星际移民局则处理和外星人相关的事情。纽约普通警察爱德华兹因缘际会之下加入了这一组织，成为MIB的一员，代号J，从此没有名字、没有身份，成为特警K的搭档。J应对的第一起事件就是虫族的入侵。亚基伦王子罗斯伯在地球被虫族杀害，而他随身携带的“银河系”——宇宙次原子能源的最好来源也失踪了，若虫族找到，将给亚基伦人带来毁灭性的打击。

1990年代，某城市。年愈五旬的伞匠李来福与营业员肉嫂相恋，正待两人准备结婚时，一个黑衣女人不期而至，并在新婚的床头放下一男婴臭臭。肉嫂疑为孩子是来福私生子，吵闹过后号啕而去。来福百口莫辩，想丢弃臭臭，孩子的泣哭令来福不忍。深夜，再次来到来福家的黑衣女臭臭的生母刘婷婷道出原委。原来她是报复与李来福重名的负心男友，来福听罢如释重负，他帮婷婷查找到其男友住址，但现状令人震惊。男友抛弃婷婷只身去澳洲后，生活无着，在买掉一个肾后落魄回国.

亚美的父亲惨遭黑衣人杀害，一觉醒来，父亲活生生的站在自己面前。她以为只是自己的一场噩梦，怎知醒来后的经历跟梦境完全一样，到了晚上，父亲再次惨遭黑衣人杀害，亚美也又一次从梦中醒来。这究竟是上天的礼物，还是死神的玩笑，父亲无限次被杀害，亚美无限次醒来，一次次目睹父亲惨死，亚美唯一可以做的，就是在重复的一天中寻找线索，找出杀害父亲的凶手，打破这场轮回。