《龙樱2》改编自三田纪房的同名漫画，故事发生在2005年剧版《龙樱》的10年后，讲述从龙山高中退休后一直指导私立大学经营的樱木建二(阿部宽饰)，接受了再次陷入困境的龙山高中的邀请，回来带领学生奋斗。前作中扮演学生水野直美的长泽雅美，也将以教师身份重返母校。

1940年，日本一方面深陷中国战场，另一方面与英美等国关系日益紧张。居住在东京的野上一家本来过着平静而幸福的生活。只是在这战争年代，幸福是多么奢侈和脆弱的一件事。身为进步作家的一家之长野上滋（坂东三津五郎 饰）因左倾思想被当局以妨害治安维持法的罪名逮捕，不久即受迫害致死。妻子佳代（吉永小百合 饰）强忍悲痛，坚强地抚养一双女儿初子（志田未来 饰）与照美（佐藤未来 饰）。他用自己一生的幸福和无私的母爱，护佑着孩子们健康成长……

　主人公三桥廉，喜爱棒球，初中时依靠爷爷的关系进入校队成为主力投手。毕业后，三桥搬家到其他地方，并进入当地的西浦高中读书。因为初中的阴影，三桥只是旁观着高中棒球部的种种活动。但这个高中的棒球部是个新成立的社团，因此他立即收到队内捕手阿部的邀请。阿部对他的投球赞赏有加，认为他具有超群的控球能力。然而比起这一点，阿部更欣赏三桥与投手这一位置相配的性格。随着其他角色球员的加入，西浦高中棒球部全员集结，开始前进。

1922年，一个四口带着捡来的女孩喜鹊逃荒流亡到铁路线上的一个城市。6年时间过去，大儿子梁承文与父亲到外国资本家开办的机械厂里做工，母亲帮人洗衣缝补，一家人勉强糊口。承文在党员老邓的培养下加入了共产党，领导工人开展革命运动。父亲在生日这天因劳累过度不幸被烧死，母亲由此更加领悟革命的真理，积极帮党做事，并光荣入党。因叛徒出卖，老邓、承文等人被捕，老邓不幸牺牲，母亲与党组织失去联系。8年后，母亲得知承文出狱的喜讯，前往北平去见儿子，却因承文临时有任务未能见到。不久后，母亲与党组织终于重新联系上，大家计划组织武

“信天翁号"这次要从百慕大的圣乔治港出发，预计八个月后抵达加拉帕戈斯群岛。船上的14位乘客是来自海洋学院的学生。他们的国籍不同，家庭出身背景也不一样，但在船长谢尔顿的带领下，很快学会海上生存必须的本领以及自律和相处的能力，而这一切与船长的榜样力量是分不开的。然而就在航程即将结束的时候，他们遭遇到所有海员都闻之色变的无形飑-——一秒钟内风速增加十几米。在白色的巨浪中，存活率据说只有万分之一...

因为儿子杜俊是智障，所以母亲总是担心他受伤。一次，杜俊被一辆奥迪车撞到了，他被朋友拉去报仇，结果朋友踢坏了后视镜，他们被带回警察局。被富人索赔时，杜俊成了挡箭牌。为了还债，母亲更加卖力地工作。不过，厄运并未就此结束。一天，杜俊酒后尾随一个名叫雅中的女学生，结果第二天后者的尸体就出现在屋顶。杜俊被当做唯一的嫌疑人带回警局，警察连蒙带骗让他签字画押低头认罪。