经历了许多风波的香菇镇，终于迎来了一段安宁祥和的时光。纳诺、淇淇、维加三人驾着崭新的飞船，准备离开香菇镇，去探索浩瀚未知的宇宙。在宇宙中漫无目的飞行的飞船，在纳诺、淇淇、维加的商讨下，决定飞去工具星系，寻找淇淇的爸爸妈妈。但在这之前，他们遇上了黑洞。黑洞挡住了纳诺一行的飞行，声称要将他们吞掉，像吞掉胡萝卜岛那样。纳诺一行勇敢前行，与黑洞斗智斗勇，终于摆脱了黑洞的阻挠。纳诺、淇淇、维加经历了许多困难，终于找到了淇淇爸爸，并来到了秘密基地。在这里，淇淇也见到了自己的妈妈。大家齐心协力，终于将钢铁巨钉打败了，钢

夜枭子和云蝠军团被风耀风影发现，此时风耀风影已经十分愤怒，于是两人异能量聚变为超兽神二合体，与云蝠军团对决，结果风耀风影兄妹联手重创了云蝠军团，云蝠军团经此一役损兵折将元气大伤。在这个时候冥王刚把玄易子和狮王战舰群从元空间带回冥界，并吩咐夜凌云先处置私自出战的夜枭子，再集合剩余的云蝠军团，大战一触爆发，在大战中火麟飞、天羽、龙戬、泰雷、苗条俊、夜凌云六个人被卷入时空隧道，回到了十万年前的圣战前夕，越是接近事物的起源，事物越是变得扑朔迷离。当超兽战士们亲身经历了十万年前的那场圣战，他们的信念开始崩溃。首先火

十二星座正在上课时，不小心掉入了黑洞中，却因一个不经意，触发了教室里的秘密装置，穿越进了一个光怪陆离的黑洞，最终降落至一个神秘而遥远的孤岛上。在孤岛上大家艰难生存，后来发现了野人，野人看到陌生人侵犯领

该剧主要讲述由宇宙警察机构建立的宇宙监狱沙罗格索，专门收容各种残暴的宇宙人。本来这些来自不同星球种族的邪恶罪犯们都被囚禁在模拟黑洞中，这种人工制造的黑洞内部是没有光线、没有边界的无限空间，被囚禁者从内部是绝对不可能逃脱的。但有一天沙罗格索遭到太阳系规模的宇宙风暴正面冲突，仪器故障使得囚犯们逃离了模拟黑洞的囚禁，并把沙罗格索占领，化为进攻地球的邪恶大本营

银河系外有一个KOKAKA星球，星球上住着一群美食精灵以及各种各样的生物。其中有个可爱笨拙的美食精灵伊仔误入地球变身超级伊仔，并结识了拯救他的人类朋友艾伦。艾伦和他的青梅竹马亚米一起帮助伊仔和传奇美食城老板暮老板对抗。虽然暮老板悄悄跟随伊仔、艾伦、亚米来到KOKAKA星球，但被超级伊仔、艾伦及他们的朋友打败逃回地球！

传说中，太阳系的每一颗星星都有一只守护星龙，它们都生活在星龙圣域里。但太阳系的黑洞无处不在，五百年复活一次的妖兽王，它的出现就像巨大的黑洞一样，笼罩了整个星龙圣域，吞噬阳光，吸取所有星龙的星象力量，一心想要统治整个太阳系，它就是——罗刹•暗无。为了击败罗刹•暗无妖兽王，有一个为培养斗龙战士而存在的古老族派，叫“龙武族”。龙武族分别由六大星门组建，分别是代表火象的星火罗门、代表水象的寒山星门、代表金象的孤斗星门、代表光象的月空星流门、还有代表木象的莫林天门和代表土象的皇沙星门。龙武族的族人非常神秘，一直隐蔽

未来几十年内，人类探索利用太空的程度不断加深。2040年，利用空间扭曲技术深入宇宙的“新领域号”消失于海王星附近。2047年，新领域号突然在海王星发回讯号，内容似乎为求救，于是当年设计新领域号的威尔博士（Sam Neill 饰）受命乘坐营救船“路易与克拉克”号前去施救。船长米勒（Laurence Fishburnes 饰）不甚友好，所幸路易与克拉克号很快按计划与新领域号对接。虽然生命扫描显示新领域号充满生命迹象，但搜寻之后营救队发现所有船员均死亡或消失，新领域号内制造黑洞的核心动力部分产生的震荡破坏了路易