爱思考爱探索的四年级小学生酷酷小吉与虚荣自负的发明家朵猫猫为了得到“钩钩岛最聪明的人”这一称号展开竞争。朵猫猫总是发明出各种奇怪的东西来为自己带来好处，却给其他岛民带来危害。而酷酷小吉总是冷静分析出事情的前因后果，想出办法一次次地打败朵猫猫。

在这个故事里，濑户内海并非地名，而是大阪某男子高中二年级两个男生的名字。濑户小吉身形瘦弱高挑，他曾是足球部的一员，但因和前辈关系不睦而退出社团。内海想文质彬彬，沉默寡言，却也并非只知道读书的书呆子。不知为何，这两个看起来完全没有交集的“回家部”成了朋友。每当下午放学后，他们便相约来到河边坐下。在内海去补习班前的这段时间里，两个人便海阔天空地闲聊起来。他们的话题无所不包，却又无聊空洞。当那个妖精一般的女孩樫村一期出现时，不经意间在木讷的大男孩心间激起波澜……

《你好，昨天》围绕五个家庭展开，以90年代的小吉街为背景，讲述两代人在平凡琐碎的生活中相互扶持、共同成长，最终收获亲情、友情、爱情的暖心故事。故事的主人公是一群生活在小吉街上的少男少女，在那个还没有被淘宝、微博、朋友圈支配的年代，他们有健力宝、大富翁、魂斗罗，有一群坦诚相待的小伙伴，嬉笑打闹奔跑追逐，有福同享有难同当，一起经历着短暂又美好的青春时光，然后各自悄悄长大。