本作是柯南第25部剧场版《名侦探柯南 万圣夜的新娘》的外传性质作品，回顾了高木涉和佐藤美和子之间的恋爱故事。最后附录的原创内容与《万圣夜的新娘》剧情相关，描绘了高木刑警和佐藤刑警婚礼前的样子。

在「破晓起义」后前往地球的夏亚，在那与拥有不可思议力量的少女──拉拉．逊相遇。另一方面，致力推动RX-78开发计划的阿姆罗父亲──提姆･雷，得到吉翁方面MS开发计划的核心人物──米诺夫斯基博士逃亡的消息，因而动身前往月球。在月球表面上的微光区域，展开人类史上首次的MS死斗战。时间来到宇宙世纪0079年——。距离地球最远的宇宙都市SIDE 3，以吉翁公国之名向地球联邦政府挑起独立战争。这场战争导致人类的总人口数一半死去，动乱的时代正要开始——。

五十年代的东南沿海某地，海防工作组周洁（袁霞 饰）正带领民兵夜巡，前方传来枪声，他们赶到出事地点，发现受伤倒地的通讯员黄小钢（晓梦 饰）。鲁维智（王润身 饰）刚从师部回来，得知阵地图被敌抢走，即令民兵驾船追赶。特务颜昌文（李舜才 饰）剌伤二春（王兴鑑 饰）跳海逃逸。很明显，我军驻地有敌特组织。此时在医院养伤的二春已被杀害，谁干的呢？这时林美芳（江芳 饰）进入了被怀疑的视线，她用美色引诱携带重要图纸的李坚（王昶 饰），鲁维智故意用假图纸暴露给林美芳，并趁机冒充爆破专家打入敌人内部。面对敌特头目陈封斋（杨角

11月，即将到来的全球最大购物活动之一“黑色星期五”前夜，发生了一起快递箱爆炸事件。很快，这起事件演变成了让整个日本陷入恐慌的连续爆破事件。物流仓库的新任主管舟渡艾蕾娜和团队经理梨本孔一同应对这场前所未有的危机。物流是现代社会的生命线，如何才能阻止这个连续爆破事件？当谜题被解开时，这个世界所隐藏真面目将浮出水面。