野上爱理和野上良太郎两姐弟正在准备重新开咖啡店——牛奶北斗。此时，桃塔罗斯突然出现在了良太郎的面前。因为遭到了异魔神的入侵，时间列车电王号出现了失控的情况。与此同时，外出采购食材的爱理被两个小混混缠上了。千钧一发之时，桃塔罗斯附身了良太郎，及时赶去救下了爱理。良太郎与桃塔罗斯从小混混的口中得知，有人刻意指使他们来袭击爱理。大家环顾四周，意外地发现了樱井侑斗的身影……爱理回到店里准备开业，又出现了几个恶棍冲进店里闹事，但这一次阻止了恶棍们的人，居然是侑斗。为什么侑斗会及时出现帮爱理？盯上爱理的幕后黑手到底是

《剧场版 再见了假面骑士电王 最后的倒计时》为《假面骑士电王》的剧场版，2008年上映，故事描绘了假面骑士电王的最后一场战斗。桃塔罗斯一行人结束了与异魔神们的战斗，终于过上了悠闲的生活。但最近，街头巷尾盛传，出现了一辆神秘的幽灵列车。叶奈与桃塔罗斯等4位异魔神一起出发寻找，却遇上了遭到绑架的良太郎。在敌人凌厉的攻势下，前来帮忙的侑斗身受重伤。这时，新一任假面骑士电王搭乘着崭新的时空列车前来力挽狂澜！混战中，桃塔罗斯找到了机会和良太郎对话。于是，以良太郎所言——“保护象”和一张车票为线索，桃塔罗斯一行人坐上

负塔罗斯军团联手牙鬼族袭击了银行，还偷走了电王的通行证，妄图统治全世界。为了打倒恶徒，时间列车分局成立了，桃塔罗斯等人干劲十足地开始了调查。警视厅派来了铃木刑警负责此案，铃木是个很胆小的警察，让良太郎他们哭笑不得，但又不得不协助他的工作。铃木执着于立功，独自一人潜入负塔罗斯军团的秘密基地，不料中了圈套。前来救他的良太郎等人也不幸中了陷阱，但好在成功逃脱。而此时，负塔罗斯军团已经向国会议事堂发起了进攻。为了阻止他们，假面骑士电王与月骑强强联手，击败邪恶。

良太郎一行人为了追踪异魔神而回到过去，但他们却不知道自己已经落入了牙王的圈套。当良太郎等人消灭完异魔神并想回到电王号的时侯，却发现电王号已经被牙王所劫持…… 　　众人被迫留在过去，但最坏的情况发生了。良太郎失去了成为电王的所有记忆，桃塔罗斯也因此不能附上良太郎的身体。在机缘巧合下，良太郎遇到10岁时的自己和异魔神齐格，并且在樱井的帮助下，开始了追踪电王号之旅。 　　另一方面，回到江户时代的牙王成功夺得神之列车牙王号，并抓住了追来的良太郎，他坐着牙王号回到了1988年12月26日。　　在1988年，良太郎恢