剧中捷德奥特曼将会与赛罗奥特曼，欧布奥特曼和伽古拉斯·伽古拉等同伴一起对战毁灭全宇宙的最邪恶兵器——巨大人工头脑吉尔巴里斯以及它的加拉德隆军团。

斗罗联邦科考队在极北之地发现了一枚蛋，蛋里孵化出了一个小男孩。科学家夫妇收养了这个身世不明的男孩，为他取名“轩宇”。几年过去，蓝轩宇和养父母一起过着平静的生活。然而，武魂蓝银草觉醒后，他身上却出现了越来越多的谜团。斗罗大陆进入星际时代，少年蓝轩宇考入史莱克学院，遇到了许多志同道合的朋友和伙伴。他们一起面对各种困难和挑战，经历了许多惊险刺激的冒险，成为了史莱克学院炙手可热的新星。

在未来的某个遥远星球上，一位被部族放逐的年轻铁血战士意外与名为希娅的少女结盟，他们共同踏上寻找终极对手的危险旅程。