女高中生虎视虎子，就读于都立日野南高中。某天的上学路上，她感觉有凉凉的东西碰到了自己的脸。猛地向上看去，她发现有个女孩子流着鼻涕，角挂在了电线上，动弹不得了――？！因为救下了稀里糊涂地长出奇怪的「角」的少女・鹿乃子乃子，（装作）优等生的虎视虎子的人生被搅得一团糟……一位少女（原不良）与一位鹿（？）邂逅的少女·遇见·鹿的故事就此开幕！

经历过外星人大举入侵地球后，人类知道，这些入侵者有一天一定会再回来。人类运用先前外星人所遗留下来的科技文明，发展出一套强大的地球防御系统以抵御外星人的再度入侵。然而，20年后，这些外星人却带着人类前所未见、更先进强大的武力再次入侵地球，带来更大的全球灾难，几位勇敢的年轻人，他们挺身而出，将再一次为人类生存而战斗……

七月四日这天，是美国人民举国上下庆祝独立日的日子，这样一个盛大的节日里，每个人都在庆祝。然而意外就这样的发生了，一群邪恶的武装力量侵入了地球，他们从各个方向涌来，既有来自太空，也有来自地心，独立日仿佛变成了外星人的野餐集会。就在这危难降临的时刻，拯救地球的重担落在了一个消防员，一个热爱物理学的学生，一个痞里痞气的科学家，一对看起来呆滞的电脑黑客，以及美国总统的身上，他们发现只要利用技术攻击外星人的总部就可以成功，然而这一目的显然不能轻松达成……