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如果你是神明，并且能够让妄想成为现实。那你会进行怎么样的妄想？是淫靡的世界？独裁社会？毁灭性的制裁？还是……2015年，涩谷。从6年前发生的大灾害“涩谷地震”之后复兴了的这个街区里新设立的私立高中“碧朋学园”。就读于碧朋学园的少年·宫代拓留，作为自己设立的新闻部的活动中的一环，他与新闻部的部员们追踪着被称为『新时代的狂气的再次来临』的连续杀人事件的进展……。

【本片翻译由澄空学园字幕组提供】故事是讲述一名普通的高中二年级生五河士道，突然在某一天遇上了一场大爆炸，而在这场大爆炸之中竟然出现一名身穿盔甲手持大剑的神秘美少女。原来这名少女的真正身份是“精灵”，是会给世界带来毁灭性灾难的存在，她的再次出现，将会给地球带来毁灭性的未来！然而主人公士道却有方法阻止世界毁灭，这个唯一能够阻止世界毁灭的方法就是——要与她约会！

那一天，五个世界突然被“门”连接在了一起——我们所居住的蓝色世界，被夜与魔法支配的黑色世界，祈祷着神灵守护的红色世界，由科学与电脑管理的白色世界，以及在军队和武器统治下的绿色世纪。天使、恶魔、妖精、魔女、女神。在童话与神话中的存在纷纷降临于世。就在这时，在世界各处，也出现了觉醒了异能的少女。少女们呼唤着“プログレス”（progress），并向保护、培养设施——青蓝学苑集中。少女们彼此相遇并结下羁绊，共同对抗五个世界的敌人——将世界引向终结的组织——衔尾蛇。

这次的舞台是在一个不健康的男性身体里，该身体的主人有暴饮暴食、饮酒吸烟、运动不足、精神压力巨大等多种不良因素，描绘了细胞们在这样恶劣的环境下工作的故事。