BTV档案节目形式以案件和事件现场实录回放为线索，首次披露国内大案要案、社会传奇、情感故事等；其内涵深外延广。

2010年，卓凯神秘前往泰国曼谷，与潜伏在当地的香港CIB卧底进行打击泰国毒枭的行动。就在众人完成任务即将撤离泰国之时，一场爆炸令卓凯手下卧底全部葬身火海。与此同时，卓凯好友兼CIB督察黎瑞权原因不明地被杀害，留下一个还未正式成为卧底的女警郑淑梅由卓凯接手指导。卓凯知道瑞权手下还有其他身份被删除的卧底，要还原瑞权之死的真相，必须将卧底全部找出来，卓凯与淑梅开始寻找卧底的工作。另一方面，“长兴”坐馆魏德信打算重建帮会，对字头里的叔父辈赶尽杀绝，覃欢喜虽逃过一劫，爱妻却死在他怀抱中。事后欢喜潜入警署，删除自己

这是一个鲜为人知的隐秘角落，一群溺水的女人带着诈骗，盗窃，抢劫各种斑斓的历史来到这里…… 这里还坚守着一批优秀的警察，常年如一日默默奉献与牺牲，同时，他们也爱自己的家庭，也流露着温柔善良，甚至脆弱和伤感，有血有肉…… 司法部为提高改造的效果，决定将地处偏僻山区的监狱转移到大城市，随着搬迁，双方展开了一场惊心动魄的较量，改造与反改造的斗争在监狱里逐渐升级，围绕着减刑加分更是冲突不断，勾心斗角愈演愈烈……

20世纪50年代末60年代初的香港，警匪勾结，乌烟瘴气。其中，九龙城寨更是一个龙蛇盘踞，令人闻风丧胆的混乱所在。无所事事的小青年阿豪和阿乐偶然混迹于此，为这里的乱世气氛所感染，乐不思蜀。他们合伙赌马诈钱，惹来庄家追杀，幸得当时城寨大哥肥宝出手方保住性命，二人的命运也自此发生转变。阿豪拜入肥宝门下，后与肥宝的小姨子大胆英相恋，他果敢勇猛，风头无两；阿乐当上警察，与曾和阿豪有染的女孩菲菲结婚。为了让虚荣的妻子过上幸福生活，他不惜选择贪污堕落。两个分处黑白道的好兄弟，携手打拼出一个属于他们自己的天下……

祥是一家瓦斯店的老板，他于结婚纪念日当天无意中撞见爱妻与男人在家中通奸，性格檽弱的他竟不发一句怒言，只是独自在酒吧里以酒浇愁。醉后的祥迷糊地聘请越南帮首领生为他谋杀奸夫淫妇，当祥回家后，却已把买凶杀人之事忘得一乾二净。

塞尔玛乔丹，一个深夜，在结婚助理DA克利夫马歇尔的办公室出现了。之前克利夫能阻止自己，他和塞尔玛参与非法的事。但塞尔玛是一个神秘的女人，克利夫不禁怀疑她是否有难言之隐。

某乡村发生了灭门惨案，现场十分诡异，痕迹、物证几乎被破坏殆尽，刑警队在侦破过程中又陷入“闹鬼”迷局，可怕的是犯罪仍在升级，演变成连环杀人案，刑警队从层层线索中寻找真相，最终将谜案背后的真凶缉拿归案。

五年的追逐化为泡影，随着X档案的关闭，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）和丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）被迫调任处理一些平常的案件。某天，美国得州达拉斯市发生一起爆炸案。虽然穆德和斯科莉极力疏散写字楼内的人群，但爆炸还是夺取了4名无辜者的性命，他们也因此受到上级的指摘。然而事后不久，穆德便得知4名牺牲者早在爆炸之前便已死亡，所谓爆炸案不过是某个神秘部门为了掩盖证据而实施的骗局。该部门据说多年来一直从事外星人的研究，并且他们的研究足以导致人类的

警队的“绝密档案”，是指至今仍未侦破，科学查证又不能合理解释的悬疑案件。阳任职警察部专案小组十多年，对这些谜题甚感兴趣，奈何职权所限，遂决定与好友Judy请辞警队并成立天眼研究所。成立第一天，一位神秘人物出现，提供经费并留下Helen的失踪档案。经调查后，二人发现Helen与失落文明玛雅文化有关，考古学家推论这文明乃外星人所建立，更与末日预言扯上关系。

督察江子山头脑冷静，思想慎密，做事客观，虽与独断独行的沙展徐飞合作，但仍能以柔制刚，充份利用对方敏锐的直觉和丰富的经验，屡破奇案。在江子山的帮助下，徐飞也立下不少大功，事业亦见起色，性格迥异的二人成为了好搭档和好朋友。 生活中，他们二人都纠缠于两段解不开的感情。江子山和女朋友文婉兰相恋多年，感情稳定，文婉兰的好朋友唐心如却对江子山一见钟情，文婉兰因为父亲的案件入狱后，江子山和唐心如的慢慢有所发展，但是随着文婉兰的出狱，二人感情开始动摇。徐飞对失踪多年的女朋友梁芊芊一直无法忘情，直到遇上警队的心理专家武俏君