曾经，人类与拥有凶恶咒术力的女王--妃魅祸率领的邪魔大王国的埴轮幻神发生过壮绝的战争，战争最后以人类封印了妃魅祸而获得了胜利。在那场战争的50年后，人类在平静的生活中渐渐忘记了那场战争。但是，埴轮幻神又一次出现了！与它们展开战斗的是司马迁次郎博士率领的BUILD BASE！高校生草薙剑儿借着由从BIG SHOOTER射出的各种部件装着组合而成「钢铁神吉克」，与它们展开了激烈的战斗。现在，关系到人类存亡的新的战斗开始了……

宋朝一位昏庸无道的亲王听从奸臣贼子的妖言，下令抓拿全国上下所有妙龄少女，供其享乐。一民女不幸被亲王选中入宫，无辜惨遭蹂躏，少女为了保全清白之身，一气之下咬舌自尽。一股怨气不散遂化为索命女鬼前来讨债，誓要将仇人置之死地……

孙晚宁为了保护当下的人类，在小海娜和江陵川的帮助下获取十二幻神的力量，与来自未来的负能量聚合体幻恶战斗，并在这个过程中逐渐找到失踪父亲的线索。