架空新大陆上，出现了一名跋涉中的龙族少女，操控特殊元素为武力的她，身体内存在一种神秘的力量——阳炎之息。这种力量不仅让她的寿命仅仅剩下两年，自己唯一的亲人也因为自己的阳炎之息疾病缠身！为了改变命运，她毅然踏上征程。路途凶险，此去经年，一路上究竟会发生什么呢？

特别篇主要讲述了千空航海前与龙水打交道的故事。为了换取龙水的航海技术，千空他们要在这个史前社会挖石油……

全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。面对文明毁灭的石之世界（STONE WORLD），千空决定依靠科学的力量取回原本的世界。他召集新的伙伴，创立了『科学王国』。火、铁、电气、玻璃、手机……千空等人开始跨越从石器时代到现代文明的200万年科学史。但号称灵长类最强的高中生·狮子王司所统率的『武力帝国』却阻挡在他们面前。以净化人类为目标的司，企图利用强大的武力来阻止科学的发展——STONE WARS，就此开战！

从石器时代到现代文明，登上200万年的科学史！前所未有的技艺冒险故事，在此开幕！所有人类因神秘现象瞬间石化后已过了数千年——拥有过人头脑的，天才科学少年千空醒来了。面对文明已经毁灭的石之世界，千空决定，用科学的力量将世界恢复原状。他要集结新的同伴，建立起“科学王国”。但是，灵长类最强的高中生狮子王司率领着“武力帝国”拦住了他。司以净化人类为目标，想要靠强大的武力阻止科学发展。科学与武力间爆发了激烈的战斗，最终千空率领的科学王国取得了优势。由于同伴谋反，司陷入了人工冬眠状态。接着，为了复活全人类，科学王国要

全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！前所未闻的创世冒险谭，就此开幕！

全人类因神秘现象瞬间被石化后，过了数千年——。拥有超人头脑的科学少年千空苏醒了。面对文明灭绝的石之世界，千空决心用科学的力量夺回这个世界。让体力过人的青梅竹马·大木大树苏醒，要从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，追上200万年的科学史！前所未闻的创世冒险故事，就此展开！

与司帝国的战斗结束，千空等人为了拯救被冷睡的司而开始行动。为了查明石化现象的谜，科学王国终于以地球的背面·新世界作为目标！为了航海而开始造船的千空等人，为了与航海力100亿的神腕船长成为伙伴，根据记者南的情报，让七海财阀的名门子弟、曾经乘坐帆船的男人“七海龙水”觉醒。“哈哈！世界又是我的了！”豪言壮语的龙水，以其压倒性的贪婪在村子里制作货币，享受豪华的生活。作为船长的替代，我提议要资源之王“石油”……？

宝岛激战结束后，千空等人安全返回了科学王国。他们用得到的石化装置，成功地让沉睡中的司苏醒过来。司成为了科学王国的一员！ 而人类石化的幕后黑手的根据地就在月球上，于是他们踏上了前往月球的旅程！在这个石之

机动纪元8013年 在人类灭绝的地球上剩下的大量军用机器人进行着无休无止的战争....(本动画是通过不添麻烦的谨慎进行的调查而让人愉快欣赏机器人可爱之处的节目)

全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年千空苏醒了。 从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！，在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界。