异次元人亚波妄想侵占地球，制造了一系列宇宙怪兽和地球生物合成的超兽。被称为第1号的导弹超兽贝劳克恩在日本福山市登场。前去迎战的地球防卫军全军覆没。这时，在惨遭破坏的大街上，有二位把自己生命置之度外的青年，他们是面包房的货车驾驶员北斗星司和护士小姐南夕子。二人竭尽全力救援遇难的人们，但终于精疲力尽倒在瓦砾中，但被艾斯·奥特曼所救。而艾斯竟然把自己的生命溶入了二人的身体中......

随着阿姬、咪库和玲实力逐渐变强，她们三位开始和其他怪兽娘前辈一样，需要外出执行任务。怪兽娘虽然拥有比常人强大的实力，但是也会有失控的风险。所以每一位怪兽娘除了要提高自身实力外，还时刻控制体内的力量，防止能力出现失控现象。影子的出现，似乎预示着一场阴谋的降临。虽然怪兽娘早就发现了影子的存在，但是，影子总是躲在隐秘的角落里，偷偷地干坏事。怪兽娘虽然气得跺脚，却也无可奈何。不过，随着大家的深入调查，事情似乎并没有那么简单，敌人不只有影子，影子只是最低级的小兵，后面还有更加强大的敌人。伴随着影子带来的破坏越来越大

从行星波利斯逃脱等待重返地球的空间盘龙号，自称“雷奥尼克斯猎人”的神秘男子侵入其中。同时，其他的宇宙人们也正暗中开始行动，ZAP SPACY的船员们被卷入战争。

21世纪中叶超能力者数量激增，泛滥的超人开始争夺有限的怪兽资源，过分强调战斗场面的风气也带来了巨量的破坏，民间怨声载道。快递侠加入超协,在超协的治理下，超能力犯罪受到一定遏制。整个城市治安得到改善。

宇宙发生了异变，新的强敌出现！许多不该出现的凶恶怪兽和外星人纷纷出现！有人在偷偷谋划一场巨大的阴谋，如今，阴谋渐渐浮出水面。众多奥特战士们联手，前来解开谜团的真相。

有关本剧的情报并不多，不过有消息源指出，该剧类似《银河奥特曼》，即主角艾克斯奥特曼可以 使用其他奥特曼战士/怪兽的力量，不过区别点在于，主角艾克斯奥特曼可以借助特殊的卡牌使用其他奥特曼战士/怪兽的力量（类似银河奥特曼的火花软胶人偶超变身设定），比如艾克斯奥特曼能数码哥莫拉卡牌“合体，并且从海报的左上方我们能看到同数码哥莫拉卡牌“合体”的X奥特曼,看起来有机甲的视觉。

奥特战士与贝利亚之间的战斗被地球人奉为传说一直流传了下来。在六年前的地球上曾出现过怪兽，那场混乱平息之后，人们一直过着和平的日子。主人公朝仓陆从小不知道自己的双亲是谁。他在小时候遇见了佩嘉萨星人——佩嘉，他目前住在星云庄内，是一位崇拜英雄的普通青少年。某天，六年前的怪兽再次出现！星云庄被它肆意践踏，小陆和佩嘉不知该逃往何处，此时他们意外地发现了藏在地底的秘密基地。从基地的莱姆那里拿到了“奥特胶囊”的小陆，变身成了捷德奥特曼！这位奥特战士成功击退了怪兽，但他的外形却酷似贝利亚。在那之后，怪兽们接二连三地出现

一千年前，血月当空，空间裂缝开启，怪兽时代降临！无数怪兽，肆虐全球，就在人类即将面临着彻底灭亡的时刻，兽魂师的诞生，给全人类带来了希望的曙光，伴随着兽魂师的一代代传承和发展，人类成功创造出了新的文明秩

故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，一名外星人意外从宇宙坠落，他手持有着象征身份的红色宇宙回旋镖“奥美迦头镖”，并有着“究极”的称号。\n失去过往记忆的外星人 “奥美迦” 化身为地球人