梦幻书院开学啦！明月隐高树，长河没晓天，新学期天文小剧场即将开讲啦! 当我们望向夜空时，无限的宇宙在等着我们！和书院的师生们一起去探索吧！

在晨雾弥漫的京都舞鹤湾发现了一艘可疑船只。那艘船上残存的数据和零件，确认是日本所没有的东西。那个消息让日本全国都紧张起来。

传说在芭罗慈遗迹中封印着太古时代的地狱。然而对文物古迹有着强烈好奇心的黑崎硬是解开了该封印！随后，能将世界化为地狱的阎魔兽赛高古复活了！赛高古实力超群，在它强力的攻击下，艾克斯奥特曼的光芒消失了。地球会就此迎来末日吗？为了阻止赛高古，吉奥的队员们和考古学家玉城司教授抱着必死的决心前去寻回能封印赛高古的神秘之力。在千钧一发之际，玉城司的儿子悠斗那想要保护母亲的强烈愿望引发了奇迹。初代奥特曼、迪迦奥特曼就此登场！随后，吉奥与奥特英雄们合力对付以赛高古为首的怪兽军团，激战就此展开。

朝仓陆等人从伽古拉那得知巨大人工头脑吉尔巴利斯企图抹杀全宇宙的智慧生命体，它为了寻找“赤钢”准备向地球发起进攻。为了阻止吉尔巴利斯，小陆等人来到了冲绳寻找“赤钢”，并在那里遇到了库西亚人比嘉爱琉，在她的带领下，他们终于在石像前找到了“赤钢”，然而小陆却无法令“赤钢”觉醒。就在此时，吉尔巴利斯手下的加拉特隆军团出现了，它们向冲绳发起了攻击。小陆变身成捷德奥特曼与欧布奥特曼、赛罗奥特曼一起对抗敌人。

某日，SSP成员收到了一份神秘的包裹，神秘包裹里装的居然是艾克斯奥特曼的变身器艾克斯闪光。在艾克斯闪光的指引下，SSP队员和凯前去寻找下落不明的大地。没想到的是，凯与SSP等人在寻找大地的时候，居然遇到了伽古拉。伽古拉表面帮助SSP等人寻找大地，暗地里却有着自己的打算。宇宙魔女贼姆鲁娜乌喜欢将美丽的东西作为宝石收藏起来，如今的她已经成功收集了银河和维克特利的宝石。接下来，她打算将地球也化成宝石收藏起来。新的危机即将降临地球！

东都、西都、北都的战争结束后，在潘多拉魔塔内建立起了新政府，各都由三位都长管理。然而这三位都长却在就职演讲上扬言要歼灭创骑，一场新的危机降临了，战兔最后的实验开始了！

时隔很久，“美妙天堂”的新地区开放了！在被取名为“梦幻剧场”的表演会场，魅力所引领命运的五人组合，献上最好的演唱会，并为最盛大规模的活动“美妙天堂梦幻巡游”拉开了序幕。“美妙天堂”的偶像们将会遇上兴趣盎然的新故事。被命运选中的五人将会是谁呢？哪个组合能在“梦幻剧场”展示最好的表演呢？

终于，所有手表集齐，那一刻到来了……王者的诞生，背后隐藏着巨大的阴谋。神秘的组织突然出现，他们自称为历史的管理者。身份立场的转变，跨越时间的旅行，亲密好友的背叛……庄吾、盖茨、月读、沃兹该何去何从？而他们的所作所为，与未来紧密相关！世界会开始崩溃吗？平成时代会被推翻重来吗？最大的谜题将会揭开！

有一天SSP成员收到了寄来的神秘道具。那是艾克斯奥特曼的变身器艾克斯终端。落入敌人的陷阱而解除与Xio队员大空大地一体化的艾克斯奥特曼，SSP，流浪之旅行归来的凯，还有行踪不明的大地！地球新危机的前兆降临！寻找宇宙中拥有邪恶之心的人，拥有放大持有者的能力的黑暗圆环。准备用它将一切的美丽的东西作为宝石收藏的邪恶的宇宙魔女贼穆鲁娜奥。她已经收集了银河和维克特利的宝石，如今有了新的目标，准备把地球化成宝石收藏，似乎有什么企图的伽古拉暗中开始活动。在穆鲁娜奥率领的邪恶宇宙人军团的面前，艾克斯将要被它们变成宝石！