童年兄弟意外失散，30年后因一桩罪案相见，两人已身处不同阵营。随着对罪案调查的深入，一个多年来隐于幕后的恐怖组织渐渐浮出水面……

童年兄弟意外失散，30年后因一桩罪案相见，两人已身处不同阵营。随着对罪案调查的深入，一个多年来隐于幕后的恐怖组织渐渐浮出水面。

2010年，卓凯神秘前往泰国曼谷，与潜伏在当地的香港CIB卧底进行打击泰国毒枭的行动。就在众人完成任务即将撤离泰国之时，一场爆炸令卓凯手下卧底全部葬身火海。与此同时，卓凯好友兼CIB督察黎瑞权原因不明地被杀害，留下一个还未正式成为卧底的女警郑淑梅由卓凯接手指导。卓凯知道瑞权手下还有其他身份被删除的卧底，要还原瑞权之死的真相，必须将卧底全部找出来，卓凯与淑梅开始寻找卧底的工作。另一方面，“长兴”坐馆魏德信打算重建帮会，对字头里的叔父辈赶尽杀绝，覃欢喜虽逃过一劫，爱妻却死在他怀抱中。事后欢喜潜入警署，删除自己

突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。世界的命运托付在了一位年仅14岁的少年身上

童年兄弟意外失散，30年后因一桩罪案相见，两人已身处不同阵营。随着对罪案调查的深入，一个多年来隐于幕后的恐怖组织渐渐浮出水面……

薛家强完成三年卧底任务後，回港开设沐足店，继续收集情报。刑事情报科总督察章纪孜怀疑卓凯出狱後投入黑道，对他进行全面监视。家强与卓凯卷入器官贩卖案，联同女卧底窦亚希及保安局调查官韦作荣，合力捣破涉案集团。保安局及後新设安全情报机构，并邀得徐天堂加入，接管刑事情报科的工作。覃欢喜逃过一死後，暗中调查某社团的秘密。神秘社团原来由长兴已故龙头魏德信的弟弟魏德礼创立，他还设下布局，对家强、卓凯等展开报复。

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验……

主人公弥琉，嗜血族与人类的混血，是被寄予厚望的“和平之子”。但是，他却被作为银行袭击事件的主犯遭到逮捕，并被移送到一个特殊的监狱里。面对突然出现的怪物袭击，弥琉与左安琪等人尝试逃出此地，并对特殊监狱的所在地、被称为“青里”的废都感到不知所措……为何要将被囚禁的嗜血族送到“青里”？袭击监狱的怪物到底是什么？不得不与怪物们进行战斗的主人公们，将为大家揭开一个个谜团。

传说，在世界顶点的十二个使徒中，祐尔曼是公认最强的存在。但同时他也是最让人类猜不透的使徒，因为没人知道他想要什么，财富？名声？势力？这些在他眼里都不值一提。而如今，这样一个传说中的使徒竟然悄悄的出现在了人类帝国的军队中。人类中隐藏的邪恶势力蠢蠢欲动，使徒力量的出现让各方势力躁动不安。

2000年9月13日，第二次冲击爆发。在南极大陆上发生的这起大灾难，造成地轴偏斜、海平面上升、全球气候改变，世界人口减半。2015年，不明巨型生物“使徒”在日本登陆，并向第3新东京市袭来。国联军与使徒的作战失败，作战指挥权移至NERV。碇真嗣被父亲NERV总司令碇源堂召唤而来，NERV作战部长葛城美里带其到地下都市NERV总部。最后半推半就地驾驶着泛用人型决战兵器EVANGELION初号机与使徒对抗......