东京、大阪、京都相继发生杀人事件，5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害。警方介入调查，发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员。该集团共有成员8名，以义经的家臣名字互相称呼，且都持有一本《义经记》，被害5人手中的《义经记》均被拿走。

6件大范围的连续杀人事件发生在东京周边的数个地区。警方除了目暮警部之外，还派了各县的警员增援，小五郎也参加了搜查会议。此时柯南却因为一个偶然的契机，发现一个警察从会议中离席，并乘上了一辆跑车离去。 “那辆车……居然，是琴酒！！” “黑衣人组织”中的一员居然潜入了搜查会议，琴酒肯定是想乘坐跑车逃走。连续杀人事件莫非是“黑衣人组织”做下的罪恶勾当？事态一触即发！！如果让琴酒知道工藤新一仍然活在这个世上，那么不止新一本人，只要和他扯上关系的朋友们都会被从这个世上抹杀掉。所以在明知危机四伏的情况下，柯南仍然开始单

一天毛利小五郎收到一张请帖，里面是谜样男子的委托，需要前往横滨的一个游乐场。小五郎和柯南一行人快乐地到达欢乐的游乐场，还带上了可以出入无阻代表VIP的手表，不料正中那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场，否则便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，柯南和小五郎如果不能解开谜题，兰和少年侦探团也会随着游乐园粉身碎骨。然而更意想不到的是，那名男子居然直接称呼柯南为工藤新一。

柯南和少年侦探团在参观一座西多摩新建的双子摩天大楼时，意外的发现了黑暗组织成员琴酒(Gin)。随后又发生了杀人事件。杀人事件还在继续，共同点是每名死者身边都会留下一个小的酒杯。就在柯南和少年侦探团寻找凶手的时候，琴酒也得知他正在寻找的叛徒雪莉将在不久之后参加西多摩双子大楼的落成典礼，并准备在典礼上将她刺杀。在典礼会场上，短暂的黑暗之后又有一人被害。现场也留下了小酒杯，显示凶手和之前的为同一人。就在警方和毛利小五郎调查案件的时候，琴酒引爆了藏在大楼内的炸药，销毁了黑暗组织和常磐财团的交易证据，同时将楼顶的柯

堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时

这日柯南、小兰一行人来到米花市市政大厅，一场有关最新游戏“茧”的发布会正在这里召开。由于迥异于以往任何一款游戏的“茧”可能一举改变全球游戏业界的价值观，发布会吸引了代表日本上流社会的政治、财经、演艺界人士，50名游戏体验者也多是他们的后代，新一的父亲、推理小说大师工藤优作由于参与故事编写，也来到现场。这边热热闹闹，游戏的研发者兼负责人坚村却被杀于地下室。坚村死前留在键盘J、T、R上的血迹令柯南想到答案可能在游戏中，他利用优作的关系加入了体验者队伍，小兰、灰原哀等人也拿到了体验入场券。

工作狂老豆岩田晓（吉田钢太郎 饰）含蓄寡言，为养家日夜劳碌，冷落儿子光生（坂口健太郎 饰）。缺乏父亲关怀的光生，记忆中唯一一次同对方真正交流，就是童年某夜两人一齐玩电视游戏《FINAL FANTASY III》。某日，岩田晓无缘无故突然辞职退休，家人为此大感困惑。为找出背后原因兼重修旧好，光生决定启动「光之父亲」计划！他先推荐老豆玩多人网络RPG游戏《FINAL FANTASY XIV》，再在游戏中以神秘女玩家Maidy的身份结伴，把对方训练成高手，带他和一班网络玩家过关斩将！迷上游戏的岩田晓逐渐开怀，更

和平年代，继承了假面超人月骑衣钵的少年红渡进入森罗高中，开始了磕磕绊绊的校园生活。某天，一名仓皇落魄的越狱犯闯入高中，此人名叫杉村隆，是一个历经22年岁月未见衰老的奇怪之人。一阵混乱过后，杉村隆被觉醒的传说偶兽带走。从白峰天斗的口中得知，杉村不老的秘密极可能和22年前其亲手策划的劫持女子音乐家的事件有关，而这一切导致了最为恐怖的上古魔王传说偶兽复活。 为了粉碎传说偶兽的阴谋，红渡穿越时空回到了1986年，并且见到了自己的父亲红音也。他与父亲试图改变历史，然而一切依旧朝着最糟糕的事态发展……

「超能力开发研究所」突然遭到无数不明物体的攻击，研究所已经完全被破坏殆尽。混乱中，原本在研究所中的超能力者令与纱绫香趁隙逃了出来。数月之后，不明物体的攻击再度出现，这次的目标竟然是纱绫香，翔一闻讯之后立即变身为假面骑士亚极陀，与G3-X一同前住救援。但战斗中G4的出现让大家非常震惊。在两个月前，G4的蓝图被盗，它的力量过于强大，所以装备它的人都会性命不保。到底是谁偷走G4设计图又制造了它？不明物体的攻击到底来自何方？假面骑士亚极陀，G3-X，G4与不明物体之间的战争一触即发！

“如果神用六天创造出了世界，我将在六十分钟内破坏殆尽，创造出乐园。”突然出现的神秘男子艾斯 / 假面骑士伊甸，与信仰他的数千名信徒一起，在世界各地引发多起恐怖行动。人们接连崩溃倒下，世界陷入了巨大混乱之中……为了阻止他，飞电或人、不破谏、刃唯阿、天津垓，以及灭亡迅雷站的迅、灭等人站了出来，身为假面骑士，他们一边与敌人战斗，一边奋力追查真相。拥有压倒性强大力量的艾斯到底是什么人？他试图创造乐园，又有什么意图？跨越人类和AI的隔阂，拯救世界！