企业号宇宙飞船遨游在太空，在人类和外星人中间传播好意，同时也在防范敌对星球有可能的攻击行为，因为有迹象表明，星际联盟的老对头罗木兰星球有可能发起新一轮的攻击。皮卡特船长和他的船员们也在小心翼翼的观察着事态的进展，时刻准备投入战斗。可就在这时，罗木兰星球发出了和谈的讯息，星际联盟命令企业号前往谈判，当皮卡特船长第一次见到罗木兰星球新的执政官后惊呆了，原来对方就是罗木兰很久以前制造的皮卡特的人类复制品，面对这个难缠的对手，皮卡特船长和他的船员们该如何是好？

星际联邦的大敌克林贡帝国因为连年争战，经济及生态环境破坏殆尽，一位克林贡领袖遂在进取号星舰的护送下前往地球谈和，中途却遭到阴谋份子暗杀，并且嫁祸进取号…

邪恶的可汗逃脱十五年前被寇克船长拘禁的星球，他本人是一位智勇双全的领袖，但此刻已变成一个邪恶的狂人，他誓言要向寇克船长讨回血仇。于是他先劫持了一艘联邦战舰，后又偷取了寇克船长的儿子和旧情人制造的毁灭性武器。并引诱企业号投入他精心设计的圈套……

1965年，正值美国和俄罗斯先后准备向太空发射载人飞船之际，指挥官谢尔盖·科罗廖夫决定选派飞行员阿列克谢·列昂诺夫和帕维尔·贝尔耶夫执行首飞任务，提前于原计划两年执行。于此过程中，无论是两名宇航员还是指挥官和无数参与者，都面临着极大的压力和风险。万众瞩目之下，媒体同步播出了发射过程，当阿列克谢打开舱门迈出太空第一步之际，整个苏联都为之沸腾。然而在阿列克谢准备返回的时候太空服失灵，紧接着飞船舱门无法自动关闭，让他险些命丧太空…

一艘名为“格罗莫夫号”的极地破冰船突然遭遇一座移动的冰山。剧烈的碰撞导致一位极地探险家跌入海中。为了对落水者施救，船体受到重创。得知这一情况的船舶总部立刻向“格罗莫夫号”派去一位叫舍普琴科的新船长。

或许过去，又或许未来，人类大规模向宇宙殖民。当人口膨胀到五千亿的时候，散落在宇宙各个角落的人类返回故土地球，却引发了伤亡惨重的归乡战争。为了保护地球这片圣地，人类制定了盖亚制裁，约定不许任何人染指这里。可是曾经作为联合舰队舰长的哈洛克却背叛盖亚制裁，驾驶着他的阿尔卡迪亚号高举叛旗，成为逃逸一百年之久的通缉犯。

外星人入侵，他们带来了终极武器。人类的命运危在旦夕。美国总统和国民必须决定，究竟是应该相信外星人，还是害怕他们。

被困在家庭游艇上的萨曼莎，夜复一夜地生活在她个人的地狱里，回应着船上警报系统的残忍和痛苦的要求。踏上堕落深渊的旅程，她每天早上醒来都会发现前一天晚上的恐怖所留下的毁容伤疤，并寻找缺失记忆的答案:“我会杀了我的家人吗？”

身着一身白西装的戴夫看起来是个彬彬有礼的中年人，虽然身处现代纽约的他总显得和这个年代、这个大都市格格不入，但谁能想到，这个看起来非常真实的“人”其实是一架人形飞船，身体里住着许多外星小人。飞船在适应地球生活时惹了一堆麻烦之后，飞船竟然自主爱上了一个美丽的地球女人吉娜...

铃木园子的叔叔次郎吉不甘心失败，决定再次向怪盗基德发出挑战。这位坏脾气的大叔斥巨资制造了巨型的飞船贝尔·雪利二世号，并以镶嵌有名贵宝石“天空的贵妇人”的戒指作赌注，邀请基德前来挑战，看他能否在东京到大阪的这6小时时间内完成这项困难的任务。柯南、小兰等人理所当然也接到邀请，甚至电视台的人也兴师动众前来。随着时间的流逝，双方的对决悄悄展开。另一方面，恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。此前不久，红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所，并盗走一种致命的病毒。